康熙在解決了三藩、吳世璠自殺后，目光也就由西南轉(zhuǎn)入東北，而當(dāng)時的東北也的的確確是不安寧，這緣由也就是侵入黑龍江流域的俄羅斯人。
從明嘉靖到萬歷年間開始，俄羅斯沙皇伊凡四世就對西伯利亞及遠東的殖民開展進程。
明崇禎九年（清崇德元年）俄羅斯人到達鄂霍次克海，征服了整個西伯利亞全境，于是這個地區(qū)就成為了俄羅斯人的殖民地。
沙俄侵略越過外興安嶺，侵入中國黑龍江流域，燒村莊、擄掠人口，搶奪糧食和貂皮。順治元年的時候，這些人伐木造城，留兵戍守。
與康熙同時存在的，是伊凡五世的繼任者——彼得一世，彼得非常想要康熙對他稱臣納貢。在康熙九年，他命令駐扎在尼布楚城的俄羅斯官員，派人來對康熙說：“盡力求得領(lǐng)有全部大俄羅斯、小俄羅斯、白俄羅斯獨裁大君主皇帝陛下之恩惠，歸依大皇帝陛下最高統(tǒng)治之下……大皇帝陛下必將愛護中國皇帝于其皇恩浩蕩之中，并保護之，使免敵人之侵害”。這倒是像極了收小弟并且收保護費。
尼布楚俄官在到了北京以后，被康熙直接在理藩院監(jiān)禁了半個月。時間到了以后，他將彼得送給康熙的禮物給了康熙，回尼布楚復(fù)命了。
這尼布楚城，清和俄羅斯在順治年間的時候就已經(jīng)有了軍事和外交的溝通了。順治九年，清的寧古塔章京海塞，驅(qū)逐所在地的俄人，但最后被俄人擊敗。兩年后，固山額真明安達理，又逐走深如松花江沿岸的俄人，沿黑龍江而上，但還是拿雅克薩城沒什么辦法。
俄羅斯這邊呢，先后在順治十三年和十五年，兩次派使臣來到北京，但是都是因為國書的“矜夸不遜”，連順治的面都沒見到。
康熙一向沉穩(wěn)，既然要對尼布楚有所行動，必然要提前探知一下，派了個正白旗都統(tǒng)，帶了一點人去偽裝成獵人，探路去了。
當(dāng)探路的回來后，說“從璦琿城到敵人的雅克薩城，坐船逆行大概需要三個月，走路只需要一個月，但是糧食和兵器只能通過船只來運送，現(xiàn)如今缺少四十艘大船、廿六艘小船，所差的也就是五十艘小船而已了?！?br/>
他們估計雅克薩是因為木城作為依托，還有就是有槍有炮，如果有二十門紅夷大炮，就不愁拿不下雅克薩了。
康熙的想法更為成熟和聰明一點，他覺得攻城池雖然簡單，但是不如先造兩個木城在璦琿和呼瑪爾兩個地方儲存三年的糧食，一共一萬二千石。糧食可以向蒙古科爾沁上旗的蒙古人征取，不足的再找錫伯烏拉征調(diào)，牛羊找索倫族的“土人”要，兩個木城之間設(shè)置驛站。
康熙二十四年，準(zhǔn)備都已經(jīng)就緒了，清軍到達雅克薩的近郊，一共士兵一萬八千人，野戰(zhàn)炮一百五十門，攻城炮四十門。
城中的俄軍抵抗兩日后投降，清軍允許投降的俄軍撤退逃亡尼布楚，不愿意走的俄軍，被編入了滿洲八旗。
清軍把雅克薩燒了，回到璦琿。
俄羅斯這邊一看清軍撤退了，在兩個月不到以后，又來到了雅克薩城，并且在一片廢墟之上建筑了土城，大炮八門、兵丁八百七十名。后來又加了白炮一門，炸彈五百個，兵丁六十六名。
清朝這邊再次年四月十六再度攻來，攻了很久后，城中的俄軍僅剩了一百一十五人，還在堅持，兩軍進入相持后，九月份的時候，康熙接受了俄軍的求和，派人去和談。
值得注意的是，主動求和的是俄軍而不是清軍，俄國彼得一世派了兩位使者，到北京請求康熙停戰(zhàn)，康熙允了。
又過了三年，雙方的全權(quán)代表在康熙二十八年七月到了尼布楚會面，清的代表是領(lǐng)侍衛(wèi)大臣索額圖，帶了一萬名士兵和隨從作為后盾，俄國的代表是大將果魯囫，帶的并一千五百人。
俄國的意思是，雅克薩可以讓給中國，但必須要有通商的權(quán)利。
清這邊的意思是，尼布楚必要的時候可以讓，但中俄的邊界必須至少也得以額爾古納河為界，黑龍江的大小支流也要屬于中國。
七月七日，雙方第一次會議在帳篷內(nèi)開始，俄國先開口說要以黑龍江為中俄兩國邊界。索額圖說：黑龍江一帶，以至于西邊的色楞格河左岸之地，一向是清的土地，俄國必須把色楞格斯卡城尼布楚、雅克薩城及其全部屬地，完全歸還中國。
第二天，俄國要中國給出理論依據(jù)，索額圖說：俄國如果必須要色楞格斯卡與尼布楚，未嘗不可相讓，通商貿(mào)易可而駐兵絕對不可。果魯囫說必須要以黑龍江為界，索額圖大怒，退出會議帳篷。
四天后，索額圖召集手下士兵，準(zhǔn)備用武力解決問題，果魯囫聽聞消息，一邊加緊修筑防御工事，一邊找人和清方溝通，表示愿意接受清方的條件，請清方不要動武。
雙方在七月二十三日正式締結(jié)條約，一共有九條，兩國以額爾占納河、格爾必齊河、綽爾納河與外興安嶺為界。
雅克薩被毀，城內(nèi)俄民被遷回俄國。
自從這個《尼布楚條約》簽訂以后，清和俄國保持了一百五十年的疆界規(guī)劃，清廷這邊認為是一次非常良好外交事件，俄國那邊也覺得是俄國外交史的一次勝利。