首先從柯南表小的那一刻開始，柯南的所有時(shí)間線就都混亂了，所以柯南變小的這一刻開始就設(shè)定為柯南元年。
　　
　　柯南元年，19年前宮野艾蓮娜與丈夫一起加入黑衣組織隸屬的實(shí)驗(yàn)室開發(fā)a藥。
　　
　　柯南元年的17年前，羽田浩司案發(fā)生。
　　
　　同年，赤井務(wù)武失蹤。
　　
　　同年柯南等一眾主角出生。
　　
　　柯南元年10年前，赤井一家人在海灘上遇到了工藤新一。
　　
　　柯南元年7年前22歲的萩原研二殉職，這里增山遠(yuǎn)改變了劇情，直接抓住了炸彈犯救下了研二，研二沒死松田也就不會在柯南元年的3年前去到搜查一課，也就不會死了。
　　
　　柯南元年5年前，赤井秀一為了秘密調(diào)查黑衣組織化名“諸星大”，佯裝被組織成員宮野明美駕駛的汽車撞傷，與明美相識后與之交往，利用這層人際關(guān)系認(rèn)識了她的妹妹——組織中擁有頂尖頭腦的科學(xué)家宮野志保，成功打入組織內(nèi)部。
　　
　　柯南元年4年前，諸伏景光和世良真純在車站站臺相遇，同年在組織殉職。
　　
　　柯南元年2年前，fbi開展秘密逮捕琴酒行動，因?yàn)榘驳吕住たㄟ~爾的失誤，導(dǎo)致行動失敗，赤井的臥底身隨之暴露，逃出組織回到美國。
　　
　　柯南變小以后的時(shí)間線就沒這么清楚了，只能從漫畫里黑衣組織出現(xiàn)的情節(jié)來判定，這里就不考慮動畫的魔改了。